تشخیص سریع چهار گونه از تاسماهیان جنس Acipenser حوضه دریای خزر و تاسماهی سیبری با استفاده از روش تکثیر ژنوم میتوکندریایی

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 استادیار انستیتو بین المللی تاسماهیان دریای خزر، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج، رشت ایران

2 مربی انستیتو بین المللی تاسماهیان دریای خزر، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج، رشت ایران

چکیده

در این تحقیق تشخیص گونه­های تاسماهیان براساس تکثیر ژنوم میتوکندری (ناحیه کنترلی D-loop) و  بررسی اختلاف اندازه باند روی ژل آگارز مورد بررسی قرار گرفتند. تعداد کل نمونه‌های مورد بررسی تاسماهیان دریای خزر و تاسماهی سیبری140 عدد بود. پس از استخراج DNA برای تکثیر ناحیه کنترلی D-loop از آغازگرهایی استفاده شد که آغازگر راست در تمامی گونه‌ها یکی و آغازگر‌های چپ متفاوت بودند و این آغازگرهای چپ طوری انتخاب شدند که اندازه قطعه‌های گونه‌های مختلف، متفاوت باشد. نتایج بیانگر این بود که برای همه گونه­های تاسماهیان دریای خزر و تاسماهی سیبری،  به غیر از فیل ماهی، قطعه مورد نظر تکثیر شده، نشان دهنده گونه برای آن نمونه باشد. این روش به جهت آسان بودن و تشخیص سریع گونه­ها، می­تواند برای ردیابی تقلب در محصولات شیلاتی حاصل از تاسماهیان و خاویار آنها به کار گرفته شود. اما به جهت اینکه ژنوم میتوکندری تنها وراثت مادری دارد؛ برای ردیابی تکمیلی ­بایستی بررسی کل ژنوم تاسماهیان برای هر گونه انجام شود تا نقاط موردنظر برای ردیابی اختلاف گونه‌های تاسماهیان دریای خزر در سطح ژنوم هسته‌ای هم بدست آمده و بتوان از تلفیق اختلاف در سطح ژنوم میتوکندریایی و هسته‌ای گونه‌ها، ارزیابی تشخیصی و بارکدینگ نمونه­های مورد نظر در محصولات شیلاتی، بهداشتی و آرایشی حاصل از تاسماهیان دریای خزر را مورد استفاده قرار داد.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Rapid detection of 4 species of Acipenser genus in the Caspian Sea Basin sturgeons and Siberian sturgeon using mitochondrial genome amplification method

نویسندگان [English]

  • shirin jamshidi 1
  • Maryam Monsef Shokri 1
  • mohammad hassanzadeh saber 2
1 Assistant professor, International Sturgeon Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Rasht, Iran.
2 Research instructor, International Sturgeon Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Rasht, Iran.
چکیده [English]

In this study, sturgeon species were identified based on mitochondrial genome amplification (D loop control region) and band size differences by agarose gel. For this purpose, a total of 140 Caspian Sea sturgeons and Siberian sturgeons were selected. After DNA extraction, primers were used to amplify the D-loop control region. The right primers were the same in all species but the left primers were different and they were selected such that the size of different species was distinct. Based on the obtained results, the desired bands for all species of Caspian Sea sturgeon and Siberian sturgeon, except Beluga, were amplified which represents the species for that sample. This method is a useful approach for detection of fraudulent mislabeling of the fishery products including sturgeon and caviar due to its ease and rapid execution. However, since the mitochondrial genome has only maternal inheritance, for additional tracking, the whole genome of sturgeon should be studied for each species in order to obtain the desired points for tracking the differences of Caspian Sea sturgeon at the nuclear genome level, thereby a diagnostic evaluation as well as barcoding of samples of fishery, health and cosmetic products from Caspian sturgeon can be done by combining differences at the mitochondrial and nuclear genome levels of the species. of the species.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Mitochondrial genome
  • D-loop
  • Caspian Sea Sturgeons
  • Siberian sturgeon
  • detection